|
Научная визуализация
| Год выпуска: | 2017 |
| Квартал: | 4 |
| Том: | 9 |
| Номер: | 4 |
| Страницы: | 59 - 66 |
|
| Название публикации: |
ТРЕХМЕРНАЯ ВИЗУАЛИЗАЦИЯ ФИЛОГЕНЕТИЧЕСКИХ ДЕРЕВЬЕВ |
| Авторы: |
М.А. Форгани (Россия), П.А.Васёв (Россия), В.Л. Авербух (Россия) |
|
Статья рекомендована к печати программным комитетом 27-й Международной конференции по компьютерной графике и зрению ГрафиКон'2017. |
| Адреса авторов: |
М.А. Форгани
majid.forqani@gmail.com
Уральский федеральный университет, Екатеринбург, Россия
П.А.Васёв
vasev@imm.uran.ru
Институт математики и механики имени Н.Н. Красовского УрО РАН, Екатеринбург, Россия
В.Л. Авербух
averbukh@imm.uran.ru
Уральский федеральный университет, Екатеринбург, Россия
Институт математики и механики имени Н.Н. Красовского УрО РАН, Екатеринбург, Россия |
| Краткое описание: |
Филогенетические деревья используются для демонстрации эволюционной взаимосвязи между видами. Предыдущие исследования показали, что существует корреляция между мутациями и изменениями физико-химических свойств аминокислот. Рассмотрение физико-химических изменений белка дает дополнительные точки зрения на изучение процесса мутации. Система VirTree была разработана для визуализации ультраметрических филогенетических деревьев. Система создает трехмерное представление деревьев, а кроме того обеспечивает представление в среде виртуальной реальности. Система кластеризует объекты филогенетического дерева на основе физико-химических свойств аминокислоты, в то время как каждый лист имеет свою последовательность белка. Листья данного дерева также могут быть кластеризованы на основе структуры дерева и ветви, в которой они расположены. Добавление новой мерности дает возможность визуализировать каждый кластер индивидуально. Алгоритм кластеризации использует метрику на основе преобразования вейвлет-пакетов и метода классического многомерного шкалирования. В дополнение к двух- и трёхмерным визуализациям реализовано представление деревьев в среде виртуальной реальности. Средства виртуальной реальности предоставляются через посредство системы Viewlang. Она позволяет создавать интерактивные трёхмерные графические приложения, работающие в браузерах. Виртуальная реальность значительно увеличивает информативность визуализации и обеспечивает широкий спектр обзора. Это позволяет увидеть общую картину больших деревьев с деталями, что затруднительно в случае «традиционных» методов визуализации из-за ограниченного размера экрана монитора. |
| Язык: |
Английский |
| DOI: |
http://doi.org/10.26583/sv.9.4.06 |
|
|
|
