|
Научная визуализация
| Год выпуска: | 2012 |
| Квартал: | 3 |
| Том: | 4 |
| Номер: | 3 |
| Страницы: | 1 - 7 |
|
| Название публикации: |
КОМПЬЮТЕРНОЕ МОДЕЛИРОВАНИЕ СУПРАМОЛЕКУЛЯРНОЙ СИСТЕМЫ, СОСТОЯЩЕЙ ИЗ МОЛЕКУЛ ФЛУОРЕСЦЕНТНЫХ КРАСИТЕЛЕЙ, ЛИПИДОВ И ВОДЫ |
| Авторы: |
С. Зайцев (Россия), М. Шапошников (Россия), Д. Соловьева (Россия), М. Бартов (Россия), П. Волынский (Россия) |
| Адреса авторов: |
С. Зайцев
s.y.zaitsev@mail.ru
Московская государственная Академия ветеринарной медицины и биотехнологии имени К.И. Скрябина, Москва, Россия
М. Шапошников
mihan2404@mail.ru
Московская государственная Академия ветеринарной медицины и биотехнологии имени К.И. Скрябина, Москва, Россия
Д. Соловьева
d.solovieva@mail.ru
Московская государственная Академия ветеринарной медицины и биотехнологии имени К.И. Скрябина, Москва, Россия
М. Бартов
_ariman_@list.ru
Институт биоорганической химии им. академиков М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова РАН, Москва, Россия
П. Волынский
Институт биоорганической химии им. академиков М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова РАН, Москва, Россия |
| Краткое описание: |
Проведено моделирование процесса взаимодействия новых производных родаминов - фотоактивируемых флуоресцентных красителей (ФФК) и липидного бислоя - аналога природных мембран на основе 1- пальмитоил-2-олеоил-sn-глицеро-3-фосфатидилхолина (ПОФХ) с помощью метода молекулярной динамики с использованием средств визуального анализа полученных результатов. Супрамолекулярная система содержала 2 молекулы ФФК, помещенные в воду по разные стороны бислоя (сверху и снизу от него), 128 молекул ПОФХ и 5258 молекул воды. Активное связывание ФФК с ПОФХ начиналось уже через 350 пс, причем обе молекулы ФФК стремились расположиться ближе к центру бислоя. В ходе изучения параметров взаимодействия ФФК с ПОФХ была рассчитана радиальная функция распределения молекул красителя относительно воды. Выявленные особенности поведения ФФК при движении сквозь липидную мембрану важны для разработки методик окрашивания такими красителями клеток и препаратов органов и тканей в медицине человека и животных. |
| Язык: |
Русский |
|
|
|
